กรมการแพทย์ เล็งเห็นความสำคัญของการขับเคลื่อนการดำเนินงานเพื่อพัฒนาไปสู่องค์กรนวัตกรรมทางการแพทย์กรมการแพทย์ที่ยั่งยืน โดยบริหารจัดการในรูปแบบคณะกรรมการบริหารจัดการนวัตกรรมกรมการแพทย์ กรมการแพทย์ เพื่อมุ่งสู่การจัดตั้งศูนย์นวัตกรรมทางการแพทย์ กรมการแพทย์ ประสานด้วยหน่วยงานต่างๆ ร่วมสนับสนุนและดำเนินงานในลักษณะโครงสร้างการดำเนินงาน ได้แก่ กองวิชาการแพทย์ สถาบันวิจัยและเทคโนโลยีทางการแพทย์ กองกฎหมายและคุ้มครองจริยธรรม สถาบันจิตเวชศาสตร์สมเด็จเจ้าพระยา กองบริหารการคลัง และที่ปรึกษากรมการแพทย์ เพื่อส่งเสริม สนับสนุน และมุ่งเน้นให้นวัตกรรมการแพทย์เป็นองค์การนวัตกรรมกรมการแพทย์ สร้างการพัฒนานวัตกรรมใหม่ๆ เช่นสิ่งใหม่ เพื่อยกระดับศักยภาพ เพิ่มศักยภาพและสมรรถนะของบุคลากรในการสร้างสรรค์นวัตกรรมที่มีประโยชน์ต่อการแพทย์ของประเทศ รวมทั้งต้องการประชาชน ในการพัฒนาสาธารณสุขให้มีการบริการด้านการแพทย์แบบครบวงจร สะดวก รวดเร็ว โปร่งใส ด้วยนวัตกรรมทางการแพทย์ที่มีประสิทธิภาพ มีมาตรฐาน และทันสมัย